#FungalManipulation #PlantFungiInteraction #SymbioticFungi #PathogenicFungi #ProteinStructures #AMFungi #EffectorProteins #LandareOsasuna #Nekazaritza #AlphaFold2 #PlantMicrobeInteractions #GatsbyCharitableFoundation #SLCU
Sainsbury Laboratory Cambridge Unibertsitateko (SLCU) zientzialariek aurkikuntza aitzindari bat egin dute, eta agerian utzi dute onddo sinbiotiko eta patogenoek, urrutiko erlazioak izan arren, antzeko proteina talde bat erabiltzen dutela landareak manipulatzeko eta bizitzeko. Ikerketa honek, onddo horietatik jariatutako proteinak IA teknologia aurreratua erabiliz alderatu dituena, landare-onddoen arteko elkarrekintzan dauden mekanismoak argitzen ditu. Aurkikuntzak ondorio garrantzitsuak dituzte nekazaritzan eta ekosistem naturaletan, tresna molekular hauek ulertzeak landare-onddoen arteko harreman onuragarriak hobetu ditzakeelako, patogenoekiko sentikortasuna areagotzeko arriskuak ere bai.
Sebastian Schornack eta SLCUko bere ikerketa-taldea mikorriza arbuskularra (AM) efektore berriak identifikatzen eta karakterizatzen ari dira, hau da, onddo sinbiotikoek jariatzen dituzten proteinak landareen sustraiak kolonizatzeko errazteko. Onddo patogenoek eta sinbiotikoek erabiltzen dituzten estrategiak argitzeko asmoz, taldeak AlphaFold2 AI ordenagailu programa erabili zuen, proteinen egiturak iragartzeko tresna indartsua. Horri esker, onddo sinbiotikoen eta patogenoen jariatutako proteinak alderatu ahal izan zituzten, azken finean, bi motatako onddoen genometan kodetutako estrukturalki antzeko proteina talde bat aurkitu zuten.
Ikerketaren aurkikuntzek ondorio handiak dituzte landareen osasunean eta nekazaritzan. Onddo sinbiotikoek, hala nola AM onddoek, funtsezko papera betetzen dute nutrienteak hartzeko, landareen hazkuntza sustatzeko eta patogenoen aurkako defentsan. Bestalde, onddo patogenoak, Fusarium oxysporum bezala, platanoak eta olio-palmondoak bezalako labore garrantzitsuak mehatxatzen dituzten patogeno suntsitzaileak dira. Partekatutako proteinak identifikatzeak, Fusarium oxysporum lycopersici domeinu bikoitzeko proteinak (FOLD) izenez ezagutzen direnak, iradokitzen du proteina horiek onddo sinbiotikoek eta patogenoek landareetan arrakastaz bizitzeko duten gaitasunari laguntzen diotela.
Schornack doktoreak azpimarratzen du laboreetan AM harremanak hobetzeak landareen hazkundeari mesede egin diezaiokeela ere, patogenoekiko duten ahultasuna areagotu dezakeela. Aurkikuntza honek proteina hauek onddo sinbiotikoetan duten presentziari eta funtzioari buruzko galderak sortzen ditu eta landare-mikrobioen elkarreraginetan izan ditzaketen ondorioei buruz.
Sinbionteek eta patogenoek erabiltzen dituzten efektoreen aniztasuna eta antzekotasuna ulertzea funtsezkoa da landare-mikrobioen arteko elkarrekintzen konplexutasunak argitzeko. Landare-patogeno-harremanetan proteina efektoreak nahiko ondo aztertuta dauden arren, landare-sinbionte-interakzioei buruzko ezagutza mugatua da, esate baterako, AM onddoekin zerikusia dutenak. Landare-sinbionte harremanean parte hartzen duten efektore desberdinak aurkitzea da Schornack Taldearen etengabeko ikerketaren ardatz nagusia.
Ikerketa aitzindari hau Gatsby Charitable Foundation, Royal Society eta Europako Ikerketa Kontseiluaren finantzaketari esker egin zen.